規模化、集約化的商品養殖發展速度加快，也增加了養殖廢水的處理難度，它的特點主要是濃度高（COD、SS、NH3-N）、水質水量變化大、有惡臭味、可生化性好等。不過隨著養殖的頭數（豬、牛、羊、兔等）和只數（雞、鴨、鵝等）的增加，養殖廢水中含有的飼料、肥料以及抗生素等污染物也會增加，造成了處理的困難。